Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Fip1l1Q9D824 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Fip1l1Q9D824 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms