Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slx4ipQ9D7Y9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slx4ipQ9D7Y9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slx4ipQ9D7Y9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms