Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem54Q9D7S1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem54Q9D7S1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms