Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmigd1Q9D7L8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmigd1Q9D7L8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163 ms