Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tube1Q9D6T1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tube1Q9D6T1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms