Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ttc9bQ9D6E4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc9bQ9D6E4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms