Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Rab11fip1Q9D620 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Rab11fip1Q9D620 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Rab11fip1Q9D620 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Rab11fip1Q9D620 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab11fip1Q9D620 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Rab11fip1Q9D620 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Rab11fip1Q9D620 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11fip1Q9D620 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Rab11fip1Q9D620 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Rab11fip1Q9D620 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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