Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc39Q9D5Y1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc39Q9D5Y1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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