Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms