Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc130Q9D516 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms