Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D4W2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms