Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gcc1Q9D4H2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcc1Q9D4H2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms