Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Efhc2Q9D485 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms