Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms