Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx29Q9D3S3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx29Q9D3S3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms