Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rufy3Q9D394 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rufy3Q9D394 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms