Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Trmt44Q9D2Q2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt44Q9D2Q2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms