Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D1F3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms