Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lmbr1lQ9D1E5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lmbr1lQ9D1E5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms