Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cysrt1Q9D1E4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cysrt1Q9D1E4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms