Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Susd3Q9D176 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Susd3Q9D176 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms