Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem53Q9D0Z3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms