Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtf2e1Q9D0D5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtf2e1Q9D0D5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms