Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mdm1Q9D067 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms