Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Shmt2Q9CZN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Shmt2Q9CZN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms