Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.3 ms