Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hdhd3Q9CYW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms