Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssu72Q9CY97 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssu72Q9CY97 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms