Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mis12Q9CY25 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mis12Q9CY25 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms