Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nip7Q9CXK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nip7Q9CXK8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nip7Q9CXK8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms