Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufaf1Q9CWX2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms