Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxxc1Q9CWW7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms