Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CWU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms