Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
4930524J08RikQ9CUJ5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms