Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930535I16RikQ9CUI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms