Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc5Q9CRA8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Exosc5Q9CRA8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms