Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl28Q9CR40 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl28Q9CR40 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms