Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FanclQ9CR14 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FanclQ9CR14 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms