Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Nicn1Q9CQM0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nicn1Q9CQM0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms