Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1bQ9CQC9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1bQ9CQC9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms