Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pkp2Q9CQ73 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkp2Q9CQ73 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp2Q9CQ73 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp2Q9CQ73 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkp2Q9CQ73 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms