Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efcab2Q9CQ46 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Efcab2Q9CQ46 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Efcab2Q9CQ46 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms