Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sike1Q9CPR7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sike1Q9CPR7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms