Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Prpf8Q99PV0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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