Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scd3Q99PL7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms