Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trem2Q99NH8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trem2Q99NH8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms