Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bco2Q99NF1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bco2Q99NF1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms