Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Brms1Q99N20 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Brms1Q99N20 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms