Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdac9Q99N13 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdac9Q99N13 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms