Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rnf17Q99MV7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf17Q99MV7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf17Q99MV7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms